Author: Bruno Danis
Mission Kerguelen: le départ
Philippe Dubois, notre Chef de Service, est actuellement en mission aux îles Kerguelen, dans le cadre du projet de recherche Proteker. L’un des membres de la mission réalise une série de vidéos pour documenter la mission, et les poste sur YouTube (channel IMBETV).
Vous pouvez les visionner ci dessous également:
PhD position on Southern Ocean sea stars genetics available at VUB
PhD scholarship (4 years) in molecular ecology at the Vrije Universiteit Brussel (VUB), Department of Biology, Marine Biology Lab, Belgium.
We are searching for a highly motivated PhD student that will work on evolution, population genetics and connectivity in Antarctic sea stars utilising a genomics approach (DNA barcoding, microsatellites and next generation sequencing) in the framework of the interdisciplinary project.
Profile of the PhD student:
Master in (marine) biology with excellent study results
Experience in genomics (lab work and bioinformatics)
Interest in the ecology and evolution of Antarctic sea stars
Excellent oral and written English skills (see here for minimal requirements)
Willingness to participate in long sampling campaigns under extreme condition in the Southern Ocean.
Obligation to finalise a doctoral thesis within 4 years
The marine biology lab offers excellent coaching in an inspiring research environment with up-to-date research facilities in the international and multilingual capital of Europe.
Interested candidates are requested to submit their application (motivation letter, two reference letters, summary of master thesis, MSc certificate with grades, proof of proficiency in English and curriculum vitae) with the subject line “RECTO PhD scholarship application” to the head of the Marine Biology Lab, Prof. Dr. Marc Kochzius (marc.kochzius@vub.ac.be) before 17. October 2016. Expected starting date is 01. January 2017.
PhD scholarship available at the VUB, Marine Biology Lab, in the framework of the RECTO project
PhD scholarship (4 years) in molecular ecology at the Vrije Universiteit Brussel (VUB), Department of Biology, Marine Biology Lab, Belgium.
We are searching for a highly motivated PhD student that will work on evolution, population genetics and connectivity in Antarctic sea stars utilising a genomics approach (DNA barcoding, microsatellites and next generation sequencing) in the framework of the interdisciplinary project
Refugia and Ecosystem Tolerance in the Southern Ocean (RECTO).
Because of its long history and geographic isolation, the Southern Ocean (SO) provides a natural laboratory for research on evolution and biodiversity. Confronted with fast-paced environmental changes, biota in Antarctic ecosystems are strongly challenged and face three possible outcomes: adaptation, migration or extinction. Past glaciation periods have already forced marine zoobenthos of the SO into refugia, being either ice-free continental shelf areas, the deep sea or sub- or peri- Antarctic regions, followed by recolonization when the ice retreated. In a multidisciplinary approach and involving all major Belgian research groups studying evolution and diversity of SO faunas, RECTO will strive at understanding how such past events have driven diversification and adaptation in different animal groups and how these can be applied as proxies to understand the contemporary situation and predict future scenarios.
The Marine Biology Lab at the VUB specialises in research on molecular ecology of marine fauna from the poles to the tropics and from invertebrates to fishes. In the new collaborative research project RECTO the evolutionary history of Antarctic sea stars will be studied.
More details here: PhD scholarship advertisement
Un coup d’oeil a la biodiversite des fonds marins Antarctiques
Que faisons-nous?
Nous sommes à bord du JCR, le James Clark Ross, un navire de recherche océanographique Britannique, qui doit son nom à un explorateur polaire Anglais.
Le James Clark Ross, a Signy Island. Photo: Bruno Danis
Le but de notre mission est de faire un inventaire, une liste, de tous les animaux qui vivent au fond de la mer (on les appelle les animaux benthiques), dans la région des Orcades du Sud. Ces îles se trouvent entre l’Amérique du Sud et la Péninsule Antarctique, et nous pensons que leur biodiversité doit être protégée. Pour cela, il est important de répertorier tous les animaux qui s’y trouvent (et beaucoup n’ont pas encore été décris), avec comme idée de pouvoir revenir plus tard pour un nouvel inventaire, qui permettra de déceler des changements dûs aux changements de l’environnement.
Comment faisons-nous?
Nous sommes dans une région qui a été relativement peu explorée. La seule manière d’inventorier les animaux qui nous intéresse est de les remonter à la surface. Nous utilisons pour cela des engins semblables à ceux qui sont utilisés par les pêcheurs, mais beaucoup plus petits, pour éviter d’abîmer les fonds. Nous utilisons notamment un AGT (Agassiz Trawl – Chalut Agassiz, du nom de son inventeur) et un traîneau EBS (Epibenthic sledge), qui permet de récolter les animaux qui sont près du fond. Avant de lancer les engins de récolte, nous “scannons” le fond, à l’aide d’un SWATH (qui permet d’avoir une image 3D du fond, très précise), qui fonctionne sur le principe de l’écholocalisation, comme les dauphins ou les chauve-souris… Nous utilisons ensuite une caméra benthique, qui nous permet de prendre de belles photos du fond. Une fois certains que les conditions sont réunies, nous déployons les engins depuis le pont arrière, et déroulons les cables pour atteindre des profondeurs de 500, 750, 1000, 1500 et 2000 m.
Capture d’ecran du SWATH en action. Les couleurs sont proportionnelles a la profondeur (bleu: plus profond; rouge: moins profond). Photo: Louise Allcock.
Nous remontons ensuite les engins et trions et identifions tous les animaux, ce qui représente un travail très intense, que nous réalisons en équipe.
Lancement du chalut Agassiz depuis le pont arriere du JCR. Photo: Bruno Danis
Une fois a bord, les echantillons sont tries dans le “WetLab”. Photo: Richard Turner
Qu’avons nous trouvé jusqu’ici?
Nous sommes à la moitié de l’expédition, et les différents endroits où nous avons travaillé (que l’on appelle des stations) montrent une diversité très différente. Certaines stations sont relativement pauvres en animaux, mais d’autres sont très riches, et nous avons probablement déjà récolté un nombre important de nouvelles espèces! Ce que nous accumulons comme information devra nous permettre de bien choisir les endroits qui doivent être protégés.
Quelques animaux recoltes au cours de la campagne. Photos: Claudio Ghiglione, Camille Moreau, Helena Wiklund, Cath Waller
Pour en savoir plus… suivez le hashtag #SoAntEco sur Twitter
Are sea urchins boring?
The Marine Biology Lab is organising a seminar next month…
Prof. Michael Russell, Villanova University, will be giving a seminar on the 8th of March ( 2PM).
The title of the seminar is:
Are sea urchins boring?
(Yes! And it is a fascinating story)
The ‘interesting’ association between ‘boring’ sea urchins and their rocky substrates
The seminar will take place at the Université Libre de Bruxelles (ULB), Solbosch campus, room UC2.236 (building U, door C 2nd floor).
Looking forward to meeting you there!
PROTEKER – Quelques moments de la campagne 2015 par Chantal DE RIDDER
Le navire français Marion Dufresne 2 réalise cinq rotations par an au départ de la Réunion. Ces rotations permettent de ravitailler les bases des Terres australes et antarctique françaises (TAAF) dans l’Océan Indien (dont Crozet, Kerguelen et Amsterdam) et d’en assurer la logistique; elles permettent aussi le transport de personnes (notamment celui des scientifiques). Une rotation dure environ 4 semaines. C’est la rotation OP3 qui nous amène aux Kerguelen. (http://www.taaf.fr)
Trajet d’une rotation passant par Crozet, Kerguelen et Amsterdam (taaf_IPEV_00e46)
Départ de La Réunion, le 13/11 à bord du Marion Dufresne
Sa 14 ; di 15 calme. Encore dans les eaux tropicales ; lu 16 – ma 17- me 18 (de plus en plus frais, on passe la convergence subtropicale ; grosse houle … mais rien d’insupportable… Je m’attendais aux pires tempêtes! Entrée progressive dans les 40èmes rugissants (Les Kerguelen se trouvent à la marge des 50èmes hurlants … des précisions qui laissent rêveur !)
Me 18/11 : Ile de la Possession (Archipel de Crozet): débarquement en hélicoptère à la base Alfred Faure, on passe la journée sur l’ile, on rejoint Port-Alfred (Baie du Marin, platier du Bollard), pour récolter des patelles (étudiées par E. Poulin, notre collègue chilien). Temps venteux mais soleil magnifique. Curieux, les manchots royaux nous observent de près !
Crozet: récolte de patelles à marée basse (Photos J. Fournier)
Crozet: récolte de patelles à marée basse (Photos J. Fournier)
Crozet: manchots royaux
Ve 20/11 : On reprend la mer- Cap sur Kerguelen. On ne s’ennuie pas à bord… Samedi 21/11 de 9h30 à 11h exposé par le médecin de bord sur les 1ers soins en cas d’urgence – théorie; à 11h, exposé de notre équipe sur nos recherches aux Kerguelen; 14h-15h30: 1ers soins – ‘pratique’ (instructif). Dimanche 22/11 : navigation en eaux calmes, acrobaties des albatros (sourcils noirs et grand albatros), des pétrels et des damiers du Cap autour du bateau.
Lu 23/11: Port Christmas – Voici enfin la côte nord de Grande Terre, l’ile principale de l’archipel des Kerguelen. Débarquement en hélico de l’équipe TREKKER, qui va traverser l’ile du nord au sud (elle va rejoindre Port-aux-Français, le 17/12 : http://www.latitudes-nord.fr/carnets-et-photos/trekker-traversee-de-l-ile-de-kerguelen), et 1ère plongée (depuis le zodiac du Marion Dufresne) pour deux membres de notre équipe, Thomas Saucède et Gilles Marty (T° de l’eau: 5°C) – au programme : relevé et remplacement des thermomètres et des placettes de colonisation ; les oursins ne seront pas au rendez-vous. Le bateau poursuit sa route vers le sud en longeant Grande Terre, encore une étape avant Port- aux-Français (PAF).
Arrivée à Port Christmas
Mise à l’eau du zodiac
Retour de plongée
Ma 24/11: Port Couvreux – Dans la brume se dessine sur la côte ce qui reste d’une ferme construite vers 1912 pour y élever des moutons, une entreprise qui périclitera après plusieurs rebondissements tragiques, les derniers habitants seront évacués en 1931 …
Du matériel est héliporté vers une des cabanes de Grande Terre; une quarantaine de cabanes y sont réparties; elles permettent aux scientifiques de rester plusieurs jours sur le terrain pour y effectuer des observations. Malheureusement pour nous, la plongée à Port Couvreux est annulée en raison des mauvaises conditions météo.
L’hélicoptère en action
Port Couvreux
Port-aux-Français, Kerguelen, le 25 novembre. Débarquement en hélicoptère, rotations hélico-bateau toutes les 5 min, cela va très vite, à peine le temps de réaliser qu’on est en vol … On atterrit, pas très loin de ‘nos’ premiers éléphants de mer! Transition rapide entre les 10 jours de mer et la terre ferme. Il y a beaucoup de vent et une jolie lumière qui joue avec les couleurs, des éléphants de mer omniprésents et notamment des bonbons (jeunes éléphants de mer dans le jargon local) et… des lapins qui gambadent une peu partout! Paysages à la végétation rase de toundra, où vert, jaune et ocre dominent mais leurs nuances varient sans arrêt avec la lumière changeante.
Les déchargements à partir de Marion Dufresne sont subitement interrompus, en cause, le vent (c’est peu dire, difficile de marcher!). Le chaland (‘L’Aventure II’) revient s’amarrer devant le port et l’hélicoptère retourne sur le pont du Marion. La mer moutonne et les rafales de vent en balaient la surface formant de larges bandes ridées bleues presque noires. Notre matériel est encore à bord. Le vent devrait mollir demain. C’est la météo qui dicte les activités, une règle incontournable ici. Pour patienter, nous avons installé notre labo dans le bâtiment BIOMAR qui héberge tous les scientifiques, et récupéré du matériel laissé par la mission PROTEKER de l’année dernière. La base de Port-aux-Français (PAF) est peuplée d’hivernants, de divers techniciens, de scientifiques de passage, …). La vie à PAF est organisée et confortable, avec ses codes et son langage … abréviations et surnoms avec lesquels il faut se familiariser. Je découvre que je suis une biolo (biologiste), qu’il y a un bib et un bibou (médecin et aide médecin), un pateux (boulanger) et des bouts de bois (menuisiers), que PAF est un village comportant outre les bâtiments de logements (L1, L2,… où les gens sont généralement regroupés par corps de métier), une bibliothèque, un restaurant (Tyker), un bar (Totoche), une salle de projection (cineker), des bâtiments techniques de toutes sortes (BT) notons que parmi ces derniers, il y a kerpou où se fait le tri des ordures (une bonne partie d’entre-elles sont rapatriées)
… Bientôt les premières plongées et les oursins! Affaire à suivre…
Vue aérienne de PAF (photo TAAF)
Le bâtiment Biomar
Premières récoltes à marée basse à PAF…
Et nos voisins …
Premières plongées … Premiers oursins !
A bord du zodiac Commerson (Ile Haute) – Photo J. Fournier
Relevé des placettes de colonisation- Photo E. Poulin
Ctenocidaris nutrix – Photo E. Poulin
Description du projet PROTEKER
http://www.proteker.net/?lang=fr
http://www.proteker.net/-PROTEKER-programme-IPEV-1044-.html?lang=en
L’équipe PROTEKER 2015 à bord du chaland, L’Aventure II
De gauche à droite : Gilles MARTY (TAAF), Chantal De Ridder (ULB), Thomas Saucède (uB), Salomé Fabri-Ruiz (uB, ULB) et Jérôme Fournier (CNRS MNHN)
L’équipe comporte aussi deux autres agents des TAAF indispensables: Romain Vergé, pilote du Commerson et Luc Baudot, son aide efficace !
De gauche à droite : Thomas Saucède (uB), Gilles MARTY (TAAF), Luc Baudot (TAAF), Chantal De Ridder (ULB), Romain Vergé (TAAF), au terme de la mission
Projet PROTEKER
Le projet PROTEKER est un programme pilote qui a pour objectif de constituer une une ligne de base pour le suivi
et l’évaluation des changements climatiques attendus sur les écosystèmes marins côtiers des Kerguelen. Il doit permettre l’inventaire (observation, échantillonnage, systématique et analyses génétiques) et le suivi (instrumentation, observation, échantillonnage, analyses trophiques et isotopiques) de ces écosystèmes. Il a aussi pour ambition finale de fournir des critères scientifiques pour les politiques de protection et de conservation des environnements côtiers des Kerguelen. La première phase du projet (2011-2014) a permis de réunir toutes les anciennes données disponibles et de sélectionner et instrumenter des stations de référence pour la mise en oeuvre d’une seconde phase plus opérationnelle. Cette seconde phase consiste prioritairement en un suivi (relevé des instruments installés, observations et prélévements associés dans le cas des placettes de colonisation) des sites, en la cartographie des habitats benthiques associés (sonar, ROV et prélévements en plongée) et en un renforcement des mesures d’observations (instrumentation et caractérisations génétiques, trophiques et écologiques de taxons indicateurs). Les résultats attendus doivent permettre de produire des modèles de distribution des habitats et de la biodiversité marine côtière des Kerguelen ainsi que de leur sensibilité aux changements environnementaux attendus (analyses éco-physiologiques – pH, tempérautre – réalisées sur base à BIOMAR).
